La deforestación y transformación de la Amazonia alertan sobre sus efectos en todo el mundo. Una preocupación es el aumento de los niveles de C emitidos. Trabajos anteriores han calculado el C fijado en los bosques amazónicos sin incluir el C almacenado en el suelo. Las moléculas de carbono orgánico en el suelo son muy sensibles a la degradación, afectando la capacidad natural de los suelos para fijar y almacenar C. Este trabajo evaluó el impacto de la degradación de la capacidad natural de los suelos amazónicos para fijar C. Treinta y cinco granjas con diferentes tipologías fueron seleccionadas en el Departamento de Caquetá, que posee las tasas más altas de deforestación y de degradación del suelo en la Amazonia colombiana. Las muestras de suelo fueron tomadas de relictos de bosques naturales, zonas de cultivo y pastos introducidos de las granjas, en lugares con alta, media y baja degradación de suelos. La biomasa aérea se calculó en los pastos con diferente nivel de degradación del suelo. Los cambios en stock C lábil se estimaron a partir del carbono orgánico del suelo y la biomasa microbiana mediante la respiración inducida por sustrato. Los resultados mostraron que el C pool se encuentra en los relictos de bosques naturales y en los cultivos de las granjas, independientemente del tamaño o tipo de granja analizada. Las colinas con una mayor intervención mostraron la más baja capacidad de fijación de C del suelo. La capacidad de fijación de C del suelo se relaciona con los cambios en la composición microbiana del suelo, donde en los terrenos conservados C es almacenado como biomasa fúngica, mientras que los suelos degradados almacenan C como biomasa bacteriana. Estas estimaciones contribuyen a establecer el costo de la sostenibilidad y la degradación del suelo en la Amazonia colombiana.

Amazonian deforestation and transformation alert about their effects worldwide. One concern is the increase of the Carbon (C) levels emitted. Previous works have estimated the fixed C in Amazon forests without including the C stored in soils. Within soil, the organic carbon molecules are highly sensitive to degradation, affecting the natural capacity of soils to fix and store C. The present study evaluates the impact of degradation in the natural capacity of Amazon soils to fix C. Thirty five farms with different typology were selected in Caquetá department which hold the highest deforestation and soil degradation rates in the Colombian Amazon. Soil samples were taken from natural forest relicts, cropping areas and introduced pastures of the farms, in locations with high, intermediate and low soil degradation. Aerial biomass was estimated in pastures with different level of soil degradation. Changes in the labile C stock were estimated from the soil organic carbon and the microbial biomass using substrate induced respiration. Results showed that the main C pool is in the natural forest relicts and the crops of the farms, independently from the size or type of farm sampled. The hills with higher intervention showed the lowest soil C fixation capacities. The soil C fixation capacity was related with changes in the soil microbial composition where conserved soils store preferentially C as fungal biomass while degraded soils store C as bacterial biomass. These estimations contribute to establish the cost of sustainability and soil degradation in the Colombian Amazon.

O desmatamento e a transformação da Amazônia alertando de seus efeitos em todo o mundo. Uma preocupação é o aumento de níveis C emitidos. Trabalhos anteriores tem calculado o C fixando em florestas amazônicas excluindo o C armazenada no solo. As moléculas de carbono orgânico no solo são altamente sensíveis à degradação, afetando a capacidade natural do solo para fixar armazenar C. Este estudo avaliou o impacto da degradação da habilidade natural dos solos da Amazônia para fixar C. Trinta e cinco diferentes tipos fazendas foram selecionados em Caqueta, que tem as maiores taxas de desmatamento e degradação do solo na Amazônia colombiana. As amostras de solo foram retiradas de remanescentes florestais em áreas naturais, zonas de cultivo e de pastagem introduzidas nas fazendas em locais com alta, média e baixa gradação. A biomassa aérea foi calculada em pastagens com diferentes níveis de degradação do solo. As mudanças nos estoques C lábil foram estimados a partir de carbono orgânico no solo e a biomassa microbiana pela respiração induzida por substrato. Os resultados mostraram que o C pool é encontrado nos relictos das florestas naturais e plantações de agrícolas das fazendas, independentemente do tamanho ou tipo de fazendas analisadas. As ladeiras com maiores intervenções apresentaram a menor capacidade fixação de C no solo. A capacidade de fixação de C do solo se relaciona com alterações na composição microbiana do solo, onde os terrenos conservados armazenam C como biomassa fúngica, enquanto que os solos degradados armazenam C como biomassa bacteriana. Estas estimativas ajudam a estabelecer o custo da sustentabilidade e da degradação do solo na Amazônia colombiana.

Los actinomicetos son importantes en la sostenibilidad de sistemas naturales. Su diversidad fue evaluada en suelos de bosque, pastizal y rastrojo, y dos profundidades en el Sur del Trapecio Amazónico Colombiano. Se analizaron suelos de cinco repeticiones por cobertura para un total de 15 unidades. Se tomaron seis muestras en cada unidad y dos profundidades, para un total de 30. Los actinomicetos cultivables se determinaron por recuento en placa, se extrajo ADN, se amplificó el gen ADNr 16s y su diversidad genética se estimó por ARDRA. Hubo diferencias de abundancia entre coberturas y profundidades, relacionadas con la vegetación, presencia de lombrices, macrofauna, altos niveles de materia orgánica, y bases totales. Se obtuvieron valores de diversidad fenotípica similares para las tres coberturas, pero los bosques son más diversos. Se identificaron 16 morfotipos, agrupados en séis géneros, siendo Streptomyces el más abundante. La heterogeneidad de los patrones ARDRA no permitió la asignación de especies, reflejándose variaciones en las secuencias de diferentes operones ADNr 16s en un mismo organismo. Las perturbaciones en la cobertura influyen sobre los actinomicetos, generando cambios en su abundancia y diversidad. Su importancia ecológica permite proponerlos como indicadores biológicos de alteración del paisaje.

Communities of Actynomicetes fungy in three vegetation types of the Colombian Amazon: abundance, morphotypes and the 16s rDNA gene. Among soil microorganisms, Actinomycetes play an important role in the sustainability of natural and agricultural systems: decomposition of organic matter; degradation of recalcitrant compounds like lignin; nitrogen fixation; degradation of agricultural chemicals and biological control in plants and animals. We evaluated their diversity in soils under three different vegetation covers (pasture, tropical primary forest and stubble) at two depths in the Southern Colombian Amazon border. We collected five replicates per vegetation type (in each, three samples at 0-20cm and three at 20-30cm; for a total of 30 samples). Abundance and phenotypic diversity were determined by plate counting. Genomic DNA was extracted from the isolates: the 16s rDNA gene was amplified with specific primers, and its genetic diversity was estimated by means of an amplified restriction analysis (ARDRA). Actynomicetes abundance varied with vegetation and depth, possibly reflecting presence of earthworms, macro-fauna and physico-chemical characteristics associated to fertility, as well as organic matter, total bases, and optimal capacity to cationic interchange. Primary forests had the highest diversity. Sixteen morpho-types (six genera) were identified; Streptomyces was the most abundant everywhere. The heterogeneity of ARDRA patterns prevented species identification because of the intra-species variability in sequences of 16s rDNA operons. This community is a biological indicator of landscape alteration and could include new bio-active compounds of pharmaceutical interest. Rev. Biol. Trop. 57 (4): 1119-1139. Epub 2009 December 01.

Capsicum sp. es una especie nativa de América de gran importancia por su diversidad de usos. La Amazonia colombiana es considerada uno de los centros de origen y alberga una gran riqueza de morfoespecies. A pesar de su importancia para el crecimiento y supervivencia de plantas bajo condiciones limitantes de nutrientes, son escasos los trabajos relacionados con la dinámica de los hongos formadores de micorriza arbuscular (HFMA) en Capsicum. Se estudió la ocurrencia de HFMA, a partir de colecta de rizósferas y raíces de ají en diferentes rutas. La colonización se evaluó por medio de la metodología de Phillips y Hayman (1970), con modificaciones de Sieverding (1983). El aislamiento y cuantificación de esporas por la técnica de Gerdeman y Nicolson (1963), modificada por Sieverding (1983). La asignación de géneros se realizó a partir de la descripción morfológica de esporas. Todas las plántulas de ají muestreadas presentaron asociaciones con HFMA. Características químicas del suelo, presencia de otras especies vegetales en chagras, fuente de colecta y especies del género Capsicum incidieron en una alta o baja alta ocurrencia de la simbiosis micorrícica. Se identificaron nueve morfotipos de endomicorrizas; Glomus sp. fue el de mayor ocurrencia.

Capsicum sp. is a native American specie highly important around the world because of its wide array of uses. The Colombian Amazon is considered one of the main origin sites that contain a richness of morph species. However, very few studies have evaluated the dynamics between Arbuscular Mycorrhizae Fungi (AMF) and red pepper in spite of its relevance to growth and survival of plants under limiting nutrient conditions. AMF occurrence was studied from the collection of roots and rhizosphere of pepper in different routes. Colonization was assessed by the Phillips and Hayman methodology (1970) with Sieverding modifications (1983). Spores isolation and quantification was evaluated by Gerdeman y Nicolson (1963) methodology and modified by Sieverding (1983). Species determination was carried out by AMF spore description. All of the evaluated red chillies pepper samples showed AMF associations. Chemical characteristics of soils, plant diversity on the chagras, different collections types and Capsicum species influenced the high and low occurrence of AMF symbiosis. Nine morph species of AMF were identified and Glomus sp. the genus most frequently related.

A presença das micorrizas arbusculares na vegetação da Amazônia pode incrementar a nutrição das plantas nos solos com baixa fertilidade. Neste estudo foi avaliada a ocorrência natural de fungos formadores de micorriza arbuscular (MA) em solos ácidos de textura argilosa no sul da Amazônia colombiana, considerando-se nas coberturas de floresta nativa, floresta secundaria jovem, e pastagens estabelecidas e duas profundidades. Foi estudada a ocorrência das MA (riqueza e abundância de esporos) com relação à: acidez, capacidade de troca de cátions, carbono orgânico, fósforo total, frações de fósforo solúvel, frações fixadas ao alumínio, ferro e cálcio e DNA total do solo. Quanto à profundidade, encontraram-se diferenças significativas, tanto para o conteúdo de DNA total e ao número de esporos. Entre as variáveis químicas o pH teve efeito significativo sob o conteúdo de DNA e o número de esporos dos fungos MA. O conteúdo de DNA foi influenciado pelas concentrações de fosfatos de alumínio do solo, em quanto a esporulação de fungos MA foi influenciada pelas concentrações de fosfatos de ferro. Concluiu-se que a abundância dos fungos MA variou dependendo da profundidade do estrato avaliada, o pH e os fosfatos minerais presentes no solo.

La presencia de micorrizas arbusculares en la vegetación de la Amazonia mejora la nutrición de las plantas en suelos de baja fertilidad. Este trabajo evaluó la presencia natural de hongos micorrícicos de tipo arbuscular (HMA) en suelos ácidos de textura franco-arcillosa a arcillosa del sur de la Amazonia colombiana bajo bosque, rastrojo joven, y praderas establecidas, a dos profundidades diferentes. Fue estudiada la presencia de HMA (riqueza y abundancia de esporas) relacionado con la acidez, la capacidad de intercambio catiónico, el carbono orgánico, el fósforo total, las fracciones de fósforo soluble y fijado al aluminio, hierro y calcio, y el ADN total del suelo. Se detectaron diferencias significativas, en el contenido de ADN total y el número de esporas respecto a la profundidad de muestreo. El pH presentó un efecto significativo sobre el contenido de ADN y el número de esporas de HMA. El contenido de ADN en el suelo se vio afectado por las concentraciones de fosfatos de aluminio, mientras la esporulación de HMA fue afectada por las concentraciones de fosfatos de hierro del suelo. Así, el número de esporas de HMA en suelos de la Amazonia se ve afectada por la profundidad, el pH y por el tipo de fosfatos minerales presentes.